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郑珩课题组在Nucleic Acids Research上发表抗菌肽数据库DRAMP的最新研究成果

作者:发布时间:2021/09/02 07:12访问量:10

近日,国际著名学术期刊Nucleic Acids Research(影响因子16.971)在线发表了我校生命科学与技术学院郑珩课题组的研究论文“DRAMP 3.0: an enhanced comprehensive data repository of antimicrobial peptides”。我校2019级硕士研究生施国邦为本文的第一作者,郑珩副教授和劳兴珍副教授为本文的共同通讯作者,中国药科大学为本文作者唯一单位。

细菌耐药性问题日趋严重,耐药细菌引起的感染已成为临床抗感染治疗面临的重要挑战。抗菌肽凭借其独特的作用机制成为潜在的新型抗菌药物,但在应用上仍受到毒副作用、体内半衰期短等不利因素制约。对已知抗菌肽序列、结构、活性、毒副作用等数据的整理,对于促进新型抗菌肽的设计和研发具有重要作用,同时这些数据也可为人工智能在多肽药物设计领域的应用奠定基础。本研究开发了抗菌肽数据库DRAMP (Data repository of antimicrobial peptideshttp://dramp.cpu-bioinfor.org/),目前已更新至第三版,不仅在数据量上超过其他同类数据库,且包含了近年来新报道的人工设计及特殊修饰的多肽,如订书结构的多肽等,并设计使用了新的修饰多肽信息记录方式,以便于更好地记录和分析修饰多肽信息,促进人工修饰多肽的设计和信息共享。数据库中数据信息完全公开,并提供了分类下载链接,方便读者下载使用。除了抗菌活性外,数据库中收录的抗菌肽还具有抗肿瘤、抗真菌以及抗病毒等多种生物活性,这些数据已被广泛用于活性多肽的设计和研发。

 


      

       该工作受到863项目、重大新药专项、国家自然科学基金面上项目和江苏高校优势学科建设工程项目等资助。数据库的前两个版本分别发表在Scientific DataScientific Report杂志上, 我校徐寒梅教授对本数据库的立项和建设给予了重大支持和帮助,硕士研究生孙健、范琳琳、康馨月等先后参与第一、二版数据库的建设和更新工作,在此一并感谢。

原文地址:https://doi.org/10.1093/nar/gkab651

 

(供稿单位:生命科学与技术学院;撰写人:施国邦)


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